遺伝学者は、新しい多型を乳がんの遺伝子調節不全に結び付けます

遺伝学者は、新しい多型を乳がんの遺伝子調節不全に結び付けます
遺伝学者は、新しい多型を乳がんの遺伝子調節不全に結び付けます
Anonim
Image
Image

乳腺のMRI。矢印は腫瘍を示します

遺伝学者は、乳がんを発症するリスクに関連するDNAの65の新しい多型と、特定のタイプの乳がん(エストロゲン非感受性がん)に関連する10の新しい多型を発見しました。さらに、これらの多型のほとんどは、特定の遺伝子の活性の調節の変化に関連しており、病気の発症のメカニズムに関する科学者の知識を拡大しました。 Nature and Nature Geneticsに掲載された論文は、乳がんの発生の遺伝学とメカニズムを研究するためのいくつかの大規模な国際プロジェクトの結果です。

多くの一般的な種類の癌の素因は遺伝します。乳がんの場合、家族性の症例がこの疾患の全症例の5〜10%を占めますが、双生児研究では、がんを発症する遺伝的素因が全症例の最大40%を説明できることが示されています。最もリスクが高いのは、DNA修復システムの構成要素をコードするBRCA1およびBRCA2遺伝子の変異によるものです。たとえば、症例の70〜80%で、ER陰性(エストロゲン非感受性)乳がんがBRCA1遺伝子の突然変異の保因者に発生します。

病気を発症するリスクを計算するために、遺伝学者は健康な女性よりも乳がんと診断された女性で発生する可能性が高いDNA変異体(一塩基多型)を探しています。圧倒的多数の症例では、一塩基多型の寄与は重要ではありませんが、多数の遺伝的変異に基づいて、疾患の発症の素因を定量的に反映するリスクスコアが決定されます。

これまでに、約120の多型が乳がんのリスクに関連していることが知られています。現在、いくつかの大規模な国際プロジェクトの結果に続いて、科学者はさらに65の新しいプロジェクトを発見しました。合計で、Natureに発表された研究には、ヨーロッパ系の12万人以上の女性、乳がんの14,000人のアジア人女性、および12万人の健康な女性が含まれていました。

参加者の半数は、OncoArrayテストを使用して遺伝子型が決定されました。このプロジェクトの一環として、国際的な研究者チームが、さまざまな種類の癌に関連するまれな変異体や既知の変異体を含む、570,000の一塩基多型を特定するためのテストを開発しました。サンプルは、International Breast Cancer Genetics and Mechanisms Consortium(BCAC)によって実施された68の個別の研究から収集されました。参加者の残りの半分のデータは、12の大規模なゲノムワイド研究のメタアナリシスから収集されました。合計で、科学者は1,180万の既知の多型について疾患との関連を分析しました。

研究によると、乳がんを発症するリスクに関連する既知の遺伝的変異の数は180に増加しました。これらの変異は合わせて、この病気の家族性症例の18%に寄与しますが、研究者はOncoArrayテストの可能性を主張しています十分に調査されておらず、40%のケースでオプションの検出に使用できます。これらの変異体のほとんどは、ゲノムの非コード領域に分類されます。つまり、遺伝子活性の調節に関連しています。

別に発表された研究で、コンソーシアムは、ヨーロッパ系の女性におけるER陰性乳がんのリスクに関連する10の新しい多型を発見しました。さらに、科学者は、このタイプの癌に関連する以前に発表された10の多型を確認しました。データはまた、癌の発生に対するBRCA遺伝子の突然変異の寄与に関するBCACおよびCIMBA(BRCA1 / 2の修飾因子の研究者コンソーシアム)コンソーシアム研究中にOncoArray分析を使用して収集されました。 ER陰性の癌に関連する突然変異のほとんどは、ER陽性の癌に関連していなかった。これは、2つのタイプの疾患の発生の独立したメカニズムを示唆している。研究者によると、発見された20の亜種と、以前に発見された100の亜種が、遺伝性ER陰性乳がんの16%を占めています。

Image
Image

特定の遺伝子を参照して、ER陰性乳がんに関連する10の多型(SNP)をリストした表

新しい研究は、著者が多型を特定しただけでなく、特定の遺伝子に対する特定の多型の影響のメカニズムを予測しようとしたという事実によって、以前のゲノムワイドな研究とは根本的に異なります。これを行うために、科学者は、組織特異的な遺伝子発現に関するデータ、およびエンハンサー(遠隔調節領域)および転写因子の結合部位の予測に関する染色体領域の相互作用に関する大規模プロジェクトからのデータを利用しました。発見された多型の多くは、転写因子の結合部位に正確に存在することが判明しました。潜在的に、この情報は腫瘍の発生に関与する新しいシグナル伝達経路を特定するのに役立ちます。

Image
Image

同定された多型によって影響を受ける細胞内経路。赤い円は遺伝子のグループを表し、緑の線は異なる経路間で重複する遺伝子を表します。図は完全には示されていません。

もちろん、遺伝的素因が存在するだけでは、病気が始まることを保証するものではありません。科学者は、「悪い」変異体の密度が最も高い分布の1%に該当する女性は、人口平均の3.5倍の乳がんを発症するリスクがあると推定しています。病気を発症するリスクの増加に関する情報は、人にライフスタイルを調整させ、予防検査をより頻繁に受けさせる可能性があります。

最近、機械学習の助けを借りて、97%以上の精度で乳房の悪性形質転換を診断することを学んだことを報告しました。

トピックによって人気があります

人気の投稿