タンパク質配列決定はエレクトロスプレーを示唆しました

ビデオ: タンパク質配列決定はエレクトロスプレーを示唆しました

ビデオ: Jpredを使ってタンパク質の二次構造予測をする 2022, 12月
タンパク質配列決定はエレクトロスプレーを示唆しました
タンパク質配列決定はエレクトロスプレーを示唆しました
Anonim
Image
Image

エレクトロスプレー

アメリカの科学者は、タンパク質や他の生体高分子を配列決定するための新しい方法の理論的実証を提案しました。これは、実際の実装の場合、このプロセスのコストを大幅に削減します。メソッドの説明は、ジャーナルPhysical ReviewAppliedに掲載されました。

今日、核酸配列決定は専門の研究所で日常的な手順になっています。ただし、タンパク質のアミノ酸配列の解読は依然として技術的に困難であり、数週間かかる可能性があり、アミノ酸あたり約70ドルの費用がかかります。

ブラウン大学の研究者は、タンパク質、核酸、その他の高分子の配列決定にエレクトロスプレーを使用することを提案しています。この方法の本質は、キャピラリーの端にある電界の作用下で、別々のイオンが溶液から放出され、真空中で質量分析計に移動することです。科学者の計画によると、タンパク質の構造をうまく解読するには、キャピラリーの出口で1つのアミノ酸を切断する必要があります。これにより、電流の作用により、質量分析計に移動します。この場合、電場はブラウン運動が分析されたアミノ酸の配列を破壊することを許しません。

研究者らは、アミノ酸を切断する2つの方法、レーザーと酵素(タンパク質の場合はプロテアーゼ、核酸の場合はエキソヌクレアーゼ)について同様の技術をモデル化しました。彼らの計算によると、レーザーがキャピラリーの端から3ナノメートルの距離で動作し、酵素が100ナノメートルの距離で動作する場合、分析の精度は95パーセントを超えます。科学者によると、これは現代の技術を使用してかなり達成可能です。

Image
Image

エレクトロスプレーの入手

方法論を実際に実装するには、多くの技術的な問題を解決する必要があります。しかし、そのようなデバイスが設計されている場合、エドマン分解やマトリックス活性レーザー脱離/イオン化などの既存の方法よりもはるかに高速かつ安価にタンパク質構造を解読することが可能になります。

数年前、ニューヨーク大学とカリフォルニア大学の研究者は、DNAのヌクレオチド配列を解読するための根本的に新しい方法を発表しました。核酸フラグメントの電気泳動に基づく最も一般的なパイロシーケンスとは異なり、この方法は、高速原子間力顕微鏡を使用して特別に準備されたDNA分子をスキャンします。

この方法の利点は、核酸の長い断片の配列を決定できるだけでなく、個々のDNA分子の配列を決定できることです(たとえば、体内に単一の細胞が存在する場合)。

トピックによって人気があります

人気の投稿